Os átomos se organizam em uma reação química de acordo com a Lei da Conservação da Massa, que afirma que a massa total dos reagentes deve ser igual à massa total dos produtos. Isso significa que os átomos presentes nos reagentes são rearranjados para formar novas substâncias.
Durante uma reação química, os átomos podem se unir, se separar ou trocar de lugar para formar novas substâncias. Essas transformações ocorrem devido às interações entre os elétrons presentes nos átomos. É importante ressaltar que a quantidade de átomos de cada elemento permanece constante durante uma reação química, apenas sua disposição é alterada.
Assim, os átomos se organizam em uma reação química de maneira a respeitar a conservação da massa e a formar compostos estáveis de acordo com a configuração eletrônica de cada elemento.