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Histologista espanhol que nasceu em Petilla de Aragón, e formou-se na Universidade de Saragoza, notabilizado por seu pioneirismo em estudos sobre a estrutura fina do sistema nervoso. Ensinou em universidades de Valência, Barcelona, e Madri. Descobriu os mecanismos controladores da morfologia (1889) e processos conectivos das células nervosas na medula espinhal.
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Nos dois anos seguintes demonstrou as mudanças básicas dos neurônios durante o funcionamento do sistema nervoso. Foi também o primeiro a isolar as células nervosas cerebrais, as chamadas células de Cajal. Por este trabalho ganhou o Prêmio Nobel em Fisiologia ou Medicina (1906), com o citologista italiano Camillo Golgi. Faleceu em Madri, cidade onde havia fundado o Instituto Cajal (1922), destinado á pesquisas sobre neuro-histologia.